Компания «Хеликон» провела обучающий вебинар на тему: «Расширенный скрининг патогенов в одной пробирке», в котором приняли участие сотрудники ВНИИОК – филиала ФГБНУ «Северо-Кавказский ФНАЦ»: Абакин С.С., Киц Е.А., Горячая Е.В., Лоптева М.С., Каниболоцкая А.А., Скокова А.В., Саприкина Т.Ю., Евлагина Д.Д., Скорых Л.Н., Сафарян Е.Ю.
Насыщенная программа вебинара была представлена Дроботовой Дианой, к.б.н., руководителем направления «Агрогеномика» и Аникаевым Алексеем, ведущим менеджером по продвижению «Геномика» и посвящена методам секвенирования нового поколения, которые позволяют получить последовательности практически всех генов каждого микроорганизма сообщества.
Лекторы рассказали об отличительных особенностях методики метагеномного анализа, который позволяет определить видовое разнообразие исследуемого образца без необходимости выделения и культивирования микроорганизмов. Осветили недостатки и преимущества.
В связи с ростом числа случаев инфекционных заболеваний, не имеющих типичной клинической картины, использование метагеномного подхода имеет особое значение, позволяя проводить детекцию широкого спектра возбудителей бактериальных, вирусных и паразитарных
заболеваний животных, растений и контаминированных почв. После была представлена актуальная информация о методах идентификации заболеваний у сельскохозяйственных животных.
Докладчики поделились информацией о работах, посвященных изучению микробиома и вирома различных биотопов почвы, растений и сельскохозяйственных животных в норме и при патологии с использованием платформ NGS. Спикеры отметили, что значительное снижение
стоимости анализа способствует расширению сфер применения технологий NGS не только в области фундаментальных, но и прикладных микробиологических исследований, включающих этиологическую диагностику инфекционных заболеваний сельскохозяйственных животных.
Особенное внимание было уделено принципу проведения метагеномного анализа данных NGS секвенирования и разборам репортов в результате обработки данных библиотек фрагментов рибосомальных оперонов. Также во время мероприятия были представлены доступные готовые решения для проведения метагеномного анализа и оснащения лабораторий молекулярно-генетической лаборатории в соответствии с действующим законодательством РФ.
Тематический вебинар имеет особенную актуальность для сотрудников института, так как исследования последних десятилетий показали, что классические методы лабораторных исследований позволяют выявлять лишь незначительную, поддающуюся культивированию, часть микроорганизмов, а метагеномный анализ позволяет выявить таксономическое многообразие микроорганизмов. Так как цена на секвенирование ДНК с каждым днём падает и описанный анализ становится всё более доступным, это в свою очередь, позволит ветеринарным специалистам широко внедрить методики метагеномных анализов в свою рутинную работу.
