ВНИИОК осуществляет подготовку кадров высшей квалификации путём обучения в аспирантуре по направлениям подготовки 35.06.01 – Сельское хозяйство, 36.06.01 – Ветеринария и зоотехния. По результатам конкурса в рамках контрольных цифр приема принято в аспирантуру в 2020 году по направлению подготовки 36.06.01 – Ветеринария и зоотехния на очную форму обучения 6 человек. Общая численность аспирантов обучающихся по очной форме обучения составляет 12 человек.
Численность лиц, прикрепленных для подготовки кандидатской диссертации составляет 2 человека. Численность лиц, защитивших кандидатские диссертации в диссертационном совете Д 999.210.02 при ФГБНУ «Северо-Кавказский ФНАЦ», ФГБОУ ВО Ставропольский ГАУ в 2020 году и успешно завершивших подготовку кандидатской диссертации составила 2 человека (Нечаев С.А., Копылов И.А.) по 2 научным специальностям (06.02.08 – кормопроизводство, кормление сельскохозяйственных животных и технология кормов; 06.02.07 – разведение, селекция и генетика сельскохозяйственных животных); после аспирантской подготовки 1 человек (Сергеева Н.В.).
ВНИИОК осуществляет организацию курсов повышения квалификации по дополнительным профессиональным образовательным программам для научно-педагогических кадров и специалистов хозяйств. Реализуется 31 дополнительная профессиональная программа по двум направлениям подготовки 35.06.01 Сельское хозяйство, 36.06.01 Ветеринария и зоотехния в объеме от 40 до 216 часов. В 2020 году реализованы следующие программы дополнительного профессионального образования:
«Иммуногенетическое тестирование овец, коз и крупного рогатого скота по группам крови и полиморфным системам белков и ферментов. Методы ДНК-диагностики сельскохозяйственных животных» (объем 72 часа); «Разведение и искусственное осеменение овец» (объем 72 часа); «Современные методологические подходы к диагностике, лечению и профилактике инвазионных болезней животных на основе инновационных технологий» (объем 72 часа). По итогам обучения выдается удостоверение о повышении квалификации установленного образца.
Молодые ученые активно принимают участие в краевых, всероссийских, международных форумах, конкурсах и конвентах, в том числе в конкурсе «УМНИК». В 2020 году в конкурсе «УМНИК» приняли участие Луцива Е.Д., Петухова Д.Д., Суховеева А.В., Гусейнова Н.В. Молодые ученые входят в состав и участвуют в работе общественных краевых организаций, таких как Совет молодых ученых и специалистов Ставропольского края, Совет молодых ученых стран СНГ.
Совместно со Ставропольским ГАУ, СКФУ и ФГБНУ «Северо-Кавказский ФНАЦ созданы базовые кафедры, осуществляющие деятельность по профилю образовательных программ (бакалавриата, магистратуры, аспирантуры) в целях практической подготовки обучающихся.